招标人和代理机构在协商招标代理费用时，应遵循公平、合理、透明的原则，并考虑项目的实际情况、代理服务的具体内容和市场行情等因素。以下是一些建议的步骤和注意事项，以帮助双方有效协商费用：

　　一、明确服务内容和范围

　　首先，招标人和代理机构应明确代理服务的具体内容和范围。这包括但不限于编制招标文件、发布招标公告、组织评标、提供法律咨询等。通过明确服务内容，双方可以更准确地评估工作量和所需投入的资源，从而为费用协商提供基础。

　　二、了解市场行情和收费标准

　　在协商费用之前，招标人和代理机构都应了解当地的招投标代理市场行情和收费标准。这有助于双方形成合理的费用预期，并避免在协商过程中出现过大的分歧。可以通过咨询同行业其他机构、查阅相关政策文件或参考过往项目经验等方式来了解市场行情。

　　三、考虑项目特点和需求

　　招标项目的规模、复杂程度、工作量以及特定需求等因素都会影响代理费用的高低。因此，在协商费用时，双方应充分考虑项目的实际情况，确保费用与项目需求相匹配。例如，对于大型、复杂的项目，可能需要投入更多的人力、物力和时间，因此费用也会相应较高。

　　四、灵活采用多种计费方式

　　招标代理费用的计费方式多种多样，包括按中标金额分段计费、固定费用、按比例收费以及混合收费等。双方可以根据项目的具体情况和双方的需求灵活选择适合的计费方式。在选择计费方式时，应确保费用的合理性和透明度，并避免出现过高或不合理的收费现象。

　　五、充分沟通和协商

　　费用协商是一个双方互动的过程，需要充分沟通和协商。招标人应明确表达自己的需求和预算限制，而代理机构则应提供详细的费用说明和计算依据。通过双方的共同努力，可以找到一个既能满足项目需求又能确保费用合理的解决方案。

　　六、签订正式合同

　　在费用协商达成一致后，双方应签订正式的招标代理合同。合同中应明确约定代理服务的具体内容、范围、费用及支付方式等条款，以确保双方权益得到保障。同时，合同还应规定违约责任和解决争议的方式等条款，以应对可能出现的风险和问题。